Axe de recherche

Biologie Quantitative

Biologie quantitative

La Biologie Quantitative a pour objectif de comprendre les principes sous-jacents de comportements biologiques complexes en termes de paramètres physiques et mathématiques. Il s’agit donc d’une approche qui concerne tous les domaines de la biologie, et qui s’appuie sur des savoir-faire technologiques tels que :

  • La biologie structurale
  • La biophysique et les microscopies, de la molécule unique au tissu
  • La bioinformatique (structurale, génomique,…) et les biostatistiques
  • La biologie des systèmes
  • La modélisation moléculaire multi-échelle

Cette communauté regroupe 40 équipes de recherche réparties dans 9 unités de recherche (CBS, CRBM, IGF, IGH, IGMM, IRIM, IRCM, LBN, LPHI).

La communauté Biologie Quantitative, dont les équipes sont soutenues par des financements prestigieux (ERC, ATIP-Avenir, Bettencourt-Schueller…), coordonne et/ou participe à 5 projets labellisés « Programme d’Investissements d’avenir » que sont l’Institut de Biologie Computationnelle (IBC), le projet de Bioinformatique structurale intégrative (Bip-Bip), et 3 infrastructures nationales dans les domaines de l’imagerie optique (France Bio-Imaging-FBI), de la biologie structurale (French Integrated Structural Biology Infrastructure – FRISBI) et de la chemo-informatique (ChemBioFrance). De plus, plusieurs équipes travaillant dans ce domaine sont des acteurs importants de réseaux internationaux prestigieux (Physics of Living Systems, LifeTime).

L’équipe appartient à l’institut Carnot CHIMIE BALARD, Prof Gilles Subra, Directeur adjoint en charge de la santé, responsable de l’axe valorisation du Pole Chimie Balard.

Partenaires industriels : Zentaris, Servier, Institut Européen de biologie Cellulaire (IEB)-Unipex, Vect-Horus et Pharmaxon, Polypeptides, Sanofi Aventis Recherche Développement)

Création d’entreprises

  • Société GENEPEP en 2008
  • Incubation d’une start-up (Helixem) depuis octobre 2012 (prix du 16e concours national d’aide à la création d’entreprises de technologies innovantes).

Partenariats : Sanofi-Pasteur, Servier, Andor, Nosopharm

Brevets

  •  « Preparation of new inhibitors of cyclophilins for treatment of viral pathologies or infections »: Colliandre, L.; Ahmed-Belkacem, A.; Pawlotsky, J.-M.; Guichou, J.-F. WO 2011076784 (2011).
  • « Method for treating protozoan parasitic diseases »: Serono D., Gazanion E., Vergnes B., Guichou JF, Labesse G. WO2012019772 (2012).
  • « Diadenosine antibacterial compounds »: Pochet, Labesse, Assairi, Gelin, EP10290679.9/ WO 2012/090136
  • « Novel pyrrolo[2,3-b]pyridine derivatives as inhibitors of the kinase ERK » Gelin M; Bessin Y. Labesse G., Cantel S; Belentova E., Lenormand P. and Guichou JF. EP 13 305424.7 (2013).
  • « Method and pharmaceutical compositions for treatment of chronic intestinal pseudo-obstruction » Faure S., Santabarbara P., Labesse G., Guichou JF. EP13305144.1 (2013).

Softwares

  • Serveur ProtSA for the calculation of solvent accessible surface in denatured states (Estrada et al., 2009).
  • Flexible-Meccano: Software to structurally describe disordered proteins and to compute associated experimental observables (Ozenne et al, 2012).
  • Plateforme ABCIS (Atelier de bio et chimie informatique structurale): http://abcis.cbs.cnrs.fr/spip/spip.php?rubrique1

Création d’entreprise : AGV Discovery (Février 2013)

Partenariats

Brevets

PCT/IB2012/051665 – Cell Penetrating Peptides For Intracellular Delivery Of Molecules. Divita, G.,
Deshayes, S., Konate, K., Morris, M.C.
PCT/IB2011/051435 – Cell Penetrating Peptides For Intracellular Delivery Of Molecules. Divita, G.,
Deshayes, S., Konate, K., Morris, M.C.
PCT/US2009/061246 – Compositions and methods inhibiting the interaction of CFTR and CAL.
Cushing PR, Madden DR, Vouilleme L, Boisguerin P, Volkmer R.
PCT/EP2011/070404 – Inhibitors of apoptosis and uses thereof. Lebleu B, Nargeot J, Boisguerin P,
Barrère-Lemaire S.
PCT/US2012/063488 – Compositions and methods inhibiting the interaction of CFTR and CAL.
Cushing PR, Madden DR, Vouilleme L, Boisguerin P, Volkmer R.

Partenariat avec la sociéte Acobiom, participation à la création et consultante.